باعتبارها مادة كيميائية، تتطلب المطهرات اهتمامًا خاصًا في مكان تخزينها. بشكل عام، يجب تخزين المطهرات في مكان-جاف وجيد التهوية، بعيدًا عن ضوء الشمس المباشر وعن وصول الأطفال، مثل مكان بارد وجاف مثل غرفة تخزين أو خزانة أو صندوق. علاوة على ذلك، يجب إبعادها عن الأطعمة والمشروبات لمنع ابتلاعها عن طريق الخطأ أو سوء استخدامها. إذا كان المطهر سائلا، فيجب تخزينه في حاوية مغلقة لمنع التسرب. عند التخزين، يجب أن تبقى منفصلة عن المواد الكيميائية الأخرى لتجنب وقوع الحوادث.
